Bacterial whole-cell biosensors illuminate spatially variable sialic acid availability within the inflamed mammalian gut
この論文は、大腸菌を用いた人工バイオセンサーを開発・活用することで、従来の測定法では捉えきれない炎症性マウス腸管内における宿主由来のシアル酸の空間的な利用可能性の動態を解明し、その治療応用可能性を示したものである。
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synthetic biology
68 件の論文
Tunable Low-Rate Genomic Recombination with Cre-lox in Escherichia coli: A Versatile Tool for Anoxic Environmental Biosensing and Synthetic Biology
この論文は、大腸菌において低頻度かつ制御可能な遺伝子組換えを可能にする精密な Cre-lox 系を開発し、それを嫌気環境下でのヒ素汚染の検出と遺伝的記録を可能にするバイオセンサーに応用したことを報告しています。
A portable orthogonal replication system enables continuous gene evolution near the biological speed limit
本研究は、大腸菌のオルソゴナル複製システム「EcORep」を大幅に改良し、さらに最も増殖速度の速い細菌「Vibrio natriegens」に移植した「VinORep」を開発することで、遺伝子進化の速度を生物学的限界に近づけ、16 時間という極めて短時間で多変異を蓄積させる新たな機能進化を可能にしたことを報告しています。
CyanOperon: an operon building expansion for the CyanoGate MoClo toolkit
本論文は、シアンバクテリアの遺伝子操作を目的とした CyanoGate モジュラークローニングキットを拡張し、最大 6 つの遺伝子からなる合成オペロンの構築、発現、および染色体への統合を可能にする「CyanOperon」システムを開発し、その有用性を大腸菌およびシアノバクテリアにおける violacein 生合成経路の構築や RBS ライブラリ解析などを通じて実証したものである。
High avidity phase-separated RNA-protein sialogranules sense lectins and inhibit influenza infection
この論文は、合成 RNA-タンパク質（sRNP）を基盤とした高親和性のシアル酸含有ナノ粒子（シオログラン）を開発し、これらがインフルエンザウイルスの細胞内侵入を阻害するだけでなく、シアル酸結合レクチンとの相互作用によって凝集状態が変化する特性を利用した糖鎖密度の定量評価法を確立したことを報告しています。
Boosted cell-free gene expression for robust signal readout from a single-copy DNA template in microdroplets
この論文は、マイクロドロplet内での単一コピーDNAテンプレートからのタンパク質発現を約10倍増幅させるために、T7 RNAポリメラーゼの添加とリボソーム濃度の低下という最適化手法を開発し、DNAが極めて少ない環境での機能スクリーニングや合成細胞の構築を可能にしたことを報告しています。
A Scalable Design for Proximity-Inducing Molecules
本論文は、希少な結合剤に依存せず、広く入手可能な阻害剤と多様な転移ハンドルを用いて標的タンパク質の翻訳後修飾を改変する拡張可能なプラットフォーム「GRIPs」を開発し、その特異性、多様性、および新たな機能付与能力を実証したものである。
Virus-free continuous directed evolution in human cells using somatic hypermutation
この論文は、ヒト免疫細胞の体細胞超変異メカニズムを利用し、ヒト B 細胞内でウイルスフリーかつ連続的にタンパク質を進化させる新たなプラットフォーム「CODE-HB」を開発し、鳥インフルエンザに対する中和抗体の獲得に成功したことを報告しています。